Zeitgleich mit den neuen Enduro-Modellen R 80 GS und R 100 GS stellte BMW 1987 für Liebhaber von Zweizylinder-Enduros die R 65 GS als Einsteigerversion vor. Im Unterschied zu den anderen neuen Modellen erinnerte sie optisch und technisch aufgrund des alten Monolever-Fahrwerks an die gerade erst eingestellte R 80 G/S mit einem Zylinderinhalt von nun 650 ccm mit 27 PS. Die niedrigen Absatzzahlen brachten BMW dazu, die R 65 GS schon 1992 wieder aus dem Programm zu nehmen, was sie heute zu einem der seltensten BMW Modelle der neueren Zeit und einem interessanten Sammler-Objekt macht.