Der BMW 525d (E39) wurde noch vor der Modellüberarbeitung der 5er Baureihe im März 2000 eingeführt und löste den BMW 525tds (E39) ab. Er übernahm die neueste Generation Dieselmotoren (M57) vom BMW 530d, aber mit verringertem Hubraum (2,5 Liter). Der Sechszylinder-Reihenmotor zeichnete sich durch seine Common-Rail Einspritzung aus, die einen ruhigen Motorlauf und dadurch höheren Fahrkomfort einbrachte. Ein Turbolader mit variabler Turbinengeometrie (VTG) reduzierte die zum damaligen Stand der Technik noch übliche Anfahrschwäche bei niedrigen Drehzahlen. Damit war das Triebwerk in seiner Leistungsentfaltung nahe an den Benzinmotoren.